本发明涉及一种有机硅改性的水性UV涂料及其制备方法，属于环保涂料技术领域。本发明的有机硅改性的水性UV涂料，其组分及质量百分含量为：有机硅改性的超支化水性聚氨酯丙烯酸酯30～55%，填料20～50%，光引发剂1～10%，助剂0～3%，水5～30%。按配比分别取有机硅改性的超支化水性聚氨酯丙烯酸酯、填料及水进行充分研磨，于40～50℃，400～600rpm转速下分散1～2h，加入光引发剂及助剂，搅拌均匀，静置即得本发明水性UV涂料。该涂料环保无毒，固化速率快，稳定性好，耐老化及耐溶剂性优良，附着力及耐磨损性能优异，适合多种涂刷方式及生产要求，可广泛应用于汽车、电子、船舶、家具和包装印刷材料的表面。