截至2014年，全院现有在职职工2931人，其中，在职科技人员1881人，在职科技人员中，拥有副高级以上职称的研究人员708人；研究生导师342人，其中博士生导师41人；拥有国家级、部级有突出贡献的中青年专家28人，享有政府特殊津贴专家30人，“百千万人才工程”国家级人选8名，院首席科学家32人。 “七五”以来至2008年，全院共有 500 多项成果获国家和省部级奖励，其中国家奖 50 多项。全院以占全国水产科研单位 25%左右的科技人员，获国家和农业部奖的成果数量占全国水产行业的 55%以上，水产学科获得国家科技奖励一等奖的 5 项成果中，水科院为主的占 4 项。 “十五”期间，全院承担各类研究课题1035项，科研经费总量达3.2亿元；116项科技成果获得各级奖励，其中国家科技进步二等奖3项、省部级奖50项。 2009年，中国水产科学研究院共获得各级科技奖励63项次（作为第一完成单位）。其中， “鲟鱼繁育及养殖产业化技术与应用”、 “罗非鱼产业良种化、规模化、加工现代化的关键技术创新及应用”2项科技成果荣获国家科技进步二等奖，“海水养殖鱼类遗传资源发掘与推广应用”等8项科技成果荣获中华农业科技奖；共有38项成果获省部级奖励。 “十一五”期间，中国水产科学研究院《我国专属经济区和大陆架海洋生物资源及其栖息环境调查与评估》《中华鲟物种保护技术》《北太平洋鱿鱼资源开发利用及其渔情信息应用服务系统》《鲟鱼繁育及养殖产业化技术与应用》《罗非鱼产业良种化、规模化、加工现代化的关键技术创新及应用》《大洋金枪鱼资源开发关键技术及应用》和《半滑舌鳎苗种规模化繁育及健康养殖技术开发与应用》7项成果喜获国家科技进步奖；《鱼类种质低温冷冻保存技术体系的建立和应用》和《中国对虾“黄海1号”新品种及其健康养殖技术》荣获国家技术发明奖。 据2016年11月中国水产科学研究院官网显示，1978年建院以来，全院共取得各类科研成果3600多项，有650多项成果获国家和省部级奖励，其中国家奖57项，全院以占全国水产科研单位20%左右的科技人员，获国家和农业部奖的成果数量占全国水产行业的50%以上。水产学科获得国家科技奖励一等奖的5项成果中，水科院为主的占4项。 据2016年11月中国水产科学研究院官网显示，图书馆引进了百链统一检索平台、中外文期刊全文数据库、文摘数据库、电子图书数据库、事实型数据库、成果数据库以及期刊评价和文献管理的软件工具等，建设了电子图书特色馆藏库、水产文摘库、渔业统计年鉴数据库、鱼类图片库等特色资源库，整合了谷歌学术、谷歌图书等网络免费学术资源；开通了中外文数据库及工具共22个，其中中文数据库5个，外文数据库14个，统计数据库、文献管理软件和多学科评价工具各1个。 中文数据库：中国知网（CNKI）、维普资讯（VIP）、万方镜像资源、搜数网统计信息资源、联合目录集成服务系统、开放获取期刊指南、万方数据。外文数据库：Web of Knowlege（SCI/DII/JCR）、ScienceDirect、SpringerProtocols（实验室指南）、工程索引（EI）、Nature（七本刊）、Agris、Agricola、FSTA、CAB Abstracts、Wiley Blackwell、Nature （1869-1986）、FARS外文学术资源整合服务系统、世界鱼类数据库（FishBase）、FAO统计资源、ProQuest、Annual Reviews、SpringerLink。 特色资源：联合目录集成服务、水产文摘库、渔业统计年鉴、水产文摘库、FishBase、FAO统计资料、开放获取期刊指南。 试用资源：ProQuest 外文电子书荐购平台、古扬全球名校学位论文整合服务系统、维普智立方、Springer电子书、大英百科全书、超星发现、台湾学术在线、超星移动图书馆。